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整形外科

医院整形美容外科暨南方整形美容激光医疗中心是华南地区成立最早的、享誉海内外的整形美容专科之一，是国家教委博士学位授权点、医院重点学科，学科专业水平位居全国前列。科室现有人员8人，医师12人，11位博士（2人为国外学位），7位医师先后赴日本、瑞士、美国等留学1～6年。另聘医师4人。共有教授、博士生导师2人、副教授5人，讲师6人。

传染感染科

医院感染内科暨肝病中心是华南地区高水平的临床感染病科室，是国家重点学科消化病系（肝病部）、广东省重点学科、广东省工程建设重点学科、教育部器官衰竭防治重点实验室、广东省病毒性肝炎研究重点实验室，中华医学会感染病学分会候任主任委员单位、广东省医学会感染病学分会主任委员单位，为博士学位授权点和临床医学博士后流动站成员单位。年牵头组建南方医科大学肝脏疾病研究所，形成一支以肝脏疾病为核心的临床和基础研究团队。经过多年的积累和发展，科室目前拥有多名具有丰富临床经验的知名专家教授以及一批活跃在医、教、研工作前线的中青年骨干，包括教授、副教授15名（其中位教授获国务院政府特殊津贴），博士生导师名，硕士生导师8名。实验室专职研究人员10人，其中研究员1名，副研究员2名，助理研究员2名，实验技师5人。

肾脏病科

医院肾内科于年组建，在两代学科带头人张训教授、侯凡凡教授的领导和建设下，学科发展迅速。年成为硕士学位授权点，年成为中国人民解放军肾脏病中心、广东省“五个一工程”重点专科，年成为博士学位授权点和国家临床药理基地科室，年被批准为中国人民解放军肾脏病研究所、临床医学博士后流动站主要学科，年成为解放军肾功能衰竭重点实验室、广东省肾脏病重点实验室。学科由专科病房、血液净化中心和肾脏病实验室三部分组成。近年来，学科在急慢性肾功能衰竭的发病机理及并发症的防治以及肾脏替代治疗等方面取得了长足的进展，形成了自己鲜明的专科特色，开发、推广了一系列新业务新技术。

病理科

作为广东省A类重点学科、广东省分子肿瘤病理学重点实验室、教育部及广东省重大疾病转录组和蛋白组学重点实验室所在单位，临床病理诊断与科研紧密结合，技术优势明显。作为广东省医院和“医院”的基础诊断学科，综合实力强，病理诊断技术全面，以给患者提供高质量的技术服务著称。年被卫生部评定为国家级病理医师培训基地。病理科现有教授/主任医师6人，副教授/副主任医师7人，讲师/主治医师10人；博士生导师4人，硕士生导师4人；大部分人员具有博士、硕士学位，长期从事临床病理诊断、教学和科研工作，在长期实践工作中积累了深厚的经验，病理诊断水平在全国具有较高的影响力。

血液科

南方医科大学(原第一军医大学)医院血液科始建于上世纪70年代，是国内较早成立的血液专科之一；经过几代人不断努力，分别于年和年成为硕士与博士授权点学科，且逐渐发展壮大成为博士后科研流动站、国家临床重点专科、国家血液病新药临床试验基地、国家专科医师培训基地等。根据学科发展需求，年成立南方医科大学血液病研究所。在白血病精准诊治、淋巴瘤/骨髓瘤靶向诊疗、造血干细胞移植及并发症防治、血友病诊疗综合关怀等方面居全国领先及先进水平。

消化病科

南方医科大学（原第一军医大学）内科消化学组始建于50年代，年正式设立消化专科。在学科奠基人周殿元教授大力倡导和带领下，年国内率先引进硬式胃镜，年率先开展纤维结肠镜检查。9年被批准为硕士学位授权点，年成为第一军医大学第一个博士学位授权点。年经中央军委批准成立全军消化内科研究所。年成为国家教育部首批全国重点学科。年被评为国家首批临床重点专科。年由广东省编制办批准设立南方消化病研究所。年入选广东省高水平大学重点建设学科。同时，作为国家药品临床研究基地专业科室、广东省“五个一科教兴医工程”重点专科、广东省首批重点专科、广东省胃肠疾病重点实验室、广东省胃肠疾病生物医学工程技术研究中心、广州市胃肠道早期肿瘤临床医学研究与转化中心，消化学科已成为院校“重中之重”发展学科。