滴虫性阴道炎的治疗方法很多，也有效，但往往不易彻底治愈。治疗必须针对阴道滴虫的生活特点（包括抗药性及宿主机体的情况），选择适宜的疗法才能获得理想的疗效。
一般治疗：治疗期间要保持外阴清洁，以防继发细菌感染，每日清洗外阴，换洗内裤并消毒；急性期不要进食辛辣之品及饮酒；禁止性生活，配偶需要一起治疗。
改变阴道酸碱度：滴虫适合生长的pH为5.5～6，因此使用醋酸洗必泰溶液冲洗阴道，可以降低阴道pH值，抑制滴虫生长。每日1次，10天为1疗程。
口服用药：由于滴虫不仅寄存于阴道内，还有可能潜藏在泌尿道下段、前庭大腺和宫颈腺体内，这种情况单靠局部上药无法起到治疗作用，因此还需要口服药物。同时，男方在一起接受治疗时，主要也是依靠口服药物。
中药外洗：使用清热解毒，杀虫止痒的中草药煎汤外洗，可以明显地缓解因滴虫感染引起的外阴炎症，尤其适用于急性滴虫性阴道炎。中西医结合治疗阴道滴虫病有很好的疗效。
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