Nature探索肠道菌群中的ldq

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肠道微生态及其产物的失调与炎症性肠病(IBD)等胃肠道疾病的发生发展紧密相关。然而,在庞大的肠道微生物基因库中,绝大部分基因及其产物的功能及活性尚未被解析,其极大地限制了我们对发病机制的理解以及新型肠道微生态制剂的开发。鉴于微生物组与人类肠道和免疫系统的长期共同进化关系,这些未知产物很有可能具有与健康相关的生物活性。这也强调了在完整微生态的条件下,体内微生物组生物活性与体外功能实验之间还存在巨大差距和未知。如何鉴定具有潜在生物活性的微生物基因产物成为一个亟待解决的问题。

年5月25日,哈佛大学陈曾熙公共卫生学院CurtisHuttenhower教授领导的合作团队在Nature上发表了题为Discoveryofbioactivemicrobialgeneproductsininflammatoryboweldisease的研究论文(第一作者张艳聪博士),研发了一套崭新的鉴别具有潜在生物活性的微生物基因组产物的计算平台MetaWIBELE,系统地鉴别出大量未被报道的与IBD紧密相关的微生物蛋白质家族,极大地拓展了IBD微生物制剂研发的潜在靶点和策略。

首先,作者研发了一种崭新的计算方法-MetaWIBELE(



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