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全外显子测序数据的解读非常复杂,相关疾病的致病突变的鉴定仍然是一个持续的挑战。阴性结果可能是由于技术方面的限制(包括非编码区和动态突变、覆盖度不够完整、单亲二倍体、大片段插入缺失、染色体重排、以及拷贝数变异)、基因与疾病之间的关联还不明确、表观遗传原因、多基因疾病或非遗传因素(毒素、缺氧、早产)。之前的研究表明重新分析数据可以增加10%-15%左右的额外阳性率,大部分是由于新发现的基因与疾病的关系、拷贝数变异,还有一种分析失败的可能原因是患者的表型没有充分理解与利用。本研究旨在评估临床医生对其患者全外显子组测序数据解读的贡献大小。
材料与方法
以色列中部RaphaelRecanatiRabin医学中心遗传研究所,对于疑似遗传病的患者由临床医生评估送第三方检测机构检测分析,从年到年,例患者外送,30例获得阳性检测结果,剩余84例阴性样本从公司要到原始数据,由临床医生自己根据患者电子病历分析候选位点。
结果
84例阴性案例的基本信息如下表,绝大部分是孩子,大部分的案例的临床表征都是神经发育方面的问题,
表1患者信息总结
其中有10例在临床医生的分析下发现能够解释患者的临床表型,这些基因与疾病的关系在之前第三方检测出报告时就已经明确,具体见表2,游侠补充:非常有意思,在这篇文章里作者还对每个案例追问第三方机构为什么没有分析出来,非常值得大家